《人民的名义》2故事发生在第一部结束五年之后。此时汉东省委书记沙瑞金(张丰毅 饰)已经成为政治局委员，侯亮平(陆毅 饰)则被提拔为副省长兼任公安厅长。沙瑞金的夫人、原本在北京开律师事务所的叶秀金(江珊 饰)放弃了北京的事务所，来到汉东省京州市沙瑞金身边，做做家务。
江珊 饰 叶秀金
故事一开始，沙瑞金的第二个儿子沙果果(董子健 饰)正在申请前往英国牛津大学留学，但学费奇高。叶秀金希望沙瑞金帮助解决，沙瑞金则让儿子自己争取奖学金。叶秀金心中不满，对自己在北京做律师时结识的商人朋友王亮(张嘉译 饰)谈起此事，王亮当即表示负责全款。事后沙果果则对父亲表示申请到了奖学金，沙瑞金大为高兴。
陆毅 饰 侯亮平
与此同时，汉东省正在侯亮平的领导下展开一场打黑风暴，背后则是沙瑞金的大力支持。沙瑞金一手通过打黑和反腐整肃官场，另一方面通过弘扬陈岩石(此时已逝世)等人代表的革命精神重塑红色精神，但此举在全国范围内评价不一。有人在网上发帖揭露沙果果在国外泡夜店、买红色法拉利，借此攻击沙瑞金表里不一。沙瑞金质问沙果果，叶秀金则轻描淡写地安抚。
京州市郊的大龙山突发一起持枪杀人的刑事案件，公安局前往调查，发现此事与当地一家民营企业家庞建华(程煜 饰)有关，遂怀疑庞建华有黑社会嫌疑，将其批捕。侯亮平得知后认为这是打黑案件的突破口之一，要求公安机关将其彻查。为获得足够证据，京州市公安局对其使用了严酷的刑求手段。
庞建华不服公安局的手段，利用其妻刘虹(蒋雯丽 饰)前来探监的机会，让她到北京请律师为自己辩护。刘虹来到北京，遍求各大律所，无人应声，最后找到以辩护手段狡诈多端闻名的律师张镇(王劲松 饰)。张镇来到汉东，随即发现庞建华一案证据存在诸多疑点，自己试图与庞建华接触，却又受到重重阻碍。张镇发动人际关系，与侯亮平私下见面，想为庞建华说话，不料侯亮平指出此案是汉东打黑的标志一案，不可能翻案。张镇当即指责侯亮平及其手下刑讯逼供，侯亮平被激怒，宣称要告张镇诽谤，双方不欢而散。
